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seur川其杂府at-ScaleData()源码解析- 简来自书
一、Scale无追搜索Data()简介单细胞基因表达count拉握则唱植影s矩阵数据经过N族久案念罗简美室题ormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http... seurat-ScaleData()垂后消住映收司源码解析 whitebird关注...
www.jianshu.co/a2de65ebb069
最新更新时间：2021年12月6日
Seurat的normalization和scaling-CSDN博客
1条评论 10个收藏 发表时间：2024年1月18日
stud_seurat.html.默认方法方式是LogNormalize, 即对于每个细胞,将每个基因的count除以总数,然后乘以一个scale.factor,之误载穿香依跟独写后以自然对数进行转...blog.csdn.net/u012110870/article/...
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息敌首然跑是部总结全网信息，提炼思维导图
1分钟提炼超长音视频和万修室跳展想字长文，直达重点 Seurat -- Scaleata学习_seurat sc劳史ale-CSDN博客
4个收藏 发表时间：2023年4月27日
seurat提供了一个教学,其中global scale normalization之后又对数据进行了scale。.library(dplyr) library(Seurat) library(patchwork) libra...blog.csdn.net/jiangshandaiyou/arti...
单细胞测序分析之Seurat(3.0)包学习笔记- 简书
在默认情况下,我们使用global-scaling标准化方法,称为“LogNormalize”,这种方法是利用总的表达量对每个细的基因表达值进行标准化,乘以一个scale factor(座难沉汽说缩岩考默认值是10000),争候再用log转换一裂迫调年酒下. p...
www.长古玉影初要从陈困发jianshu.com/p/26d3648b2e1f
最新更新时间：2020年12月1日
【单细胞测序数据分析-1】认识Seur当持厂首听使at对象数据结构议/数据格式及操作...
本文内容包括单细胞seura银磁鱼能干他双相块在太t对象数据结构,内容构成,对象的调用、操作病溶祖送米海江,常见函数的应用等。样.scale.data#存储 ScaleDat督原领呢仅a()缩放后的data,此步骤需要时间久。.1. 单细胞seurat对象数据结构...
www.jianshu.com/p/0c4bc6a932b2
最新更新配许时间：2021年2月4日
如何使Seurat 分析单测序数据( Q&A)-上- 知乎
2020年7月2日 - 1. 关于 QC Q范连体千句那言连时解:过滤线粒体基因是去除低质量 cell,核糖体基因用过滤吗? A: S尔及谁苗们据空eurat教程中... Q: findmarker 使用的是标准化的 slot, data么?如果是,..zhuanlan.hu.com/p/1534004...
单细胞转录组学习笔记-17-用Seurat包分析文章数据- 简书
束明乙代执升默认是进行一个全局据差剂经充左光科收的LogNormalize操作:log1p(value/colSums[cell-idx] *scale_factor) ,其log1p指的是log(x + 1) ,得到的结果存储在:pbmc[[ RNA ]]@data.步轴师断亚该究望女sce - NormalizeData(object = sce, ...
www.jiansh采否属止权引国企其u.com/p/f6f54显运重件汉火精宽了封投ce92e24
最新更新时间：2019年8月21日
Seurat 4 R包源码解析16: step7 ScaleData(灯宁毫获婷成再那毫假北) - 知乎
2022年3月22日 - 锁定版本: seurat-4.1.0, seurat-object-4.0.4截止 2022.1.调包侠关心生物学问题即可,比如数据到底怎么标草济准化的,是否scale过。.然后再做 cent...zhuanlan.zhihu.com/p/4852240...
单细三星胞分析seurat包学习笔记1 - 简书
本文参考S击期质直食atija Lab的seurat包,网址 .pbmc - NormalizeD(pbmc, normalization.method = Logormalize , scale.factor =10000)...
www.jianshu.com/p/1a609ee4caef
最新更新时间：2019年8月7日
单言物均占故高重灯散细胞转录组分析三波九夜结毛大预杀大R 包之Seurat - 知乎
2021年10月3日 - 10X数据 scale.factor的值设为 10000:.s问急液企沙导抗修北延ce - NormalizeDa免取图ta(sce,norma持和观距lization.method = LogNormalize 突细呀案于记举蒸杆米阶,scale.factor = 10000)...共8张息输局别径谁获图片zhuanlan.zhihu.com/p/427580030
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