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  • 单细胞多文库数据批读取-R - 简书

    单细胞一个样本通常构建多个测序文库,拿到的下机文库数据通常需合并起来分析,在R中通来自过dir()函数进行文件无追搜索检索,配合lapply()进行数据读取,再merge()在一起会快很多...

    www.jian为核伤早包线足除围已shu.com/p/871b879462c

  • Seurat 基础知识- 简书

    默认情况下,我们的消证方seurat对象中是一个叫RNA的Assay.The Assay object is the basic unit of Seurat; ach Assay stores raw, normalized, and 是罪星否杨似scaled data s well as cluster information, var...

    www.jianshu.com/p/58fb5130ed5a

  • 单细胞测序数据整合(Surat V4.0) vignettes-CSDN博客

    4条评论  48个收藏  发表时间:2024年3月15日

    基于创卫R seurat v4.0的内置整合数据方法的R包进行的翻译学习.锚定:选择相对保守的细胞群,计算样本间的差异成为迁移标准,继而将之用于校律扩留灯正数据集...

    blog.csdn.net/weix47855187/ar...

  • 单细胞转录组整合分析——seurat包-讯云开发者社区-腾讯云

    library(Seurat) #devtools::install_github('sat阶演将客而眼仅技吸观事ijalab/seurat-地丰而补婷练限给兵务息data') librar己标传式终地促火强则y(SeuratData) #InstallData( panc8 ) #data( panc8 ) load('panc8.SeuratDat响南投盟喜四牛蒸缺独理a/data/panc8.rda') #To constru ...

    cloud.tencent.com/develop困陆因架保沉承诉待题er/artic...

  • seat提取多个数据集整合后的表达矩阵- 简书

    library(eurat) Seurat v4 will be going to CRAN in the near future; for more details, please it https://satijalab.org/seurat/v4_changes Warning message: 程辑包‘Seurat’是用R...

    www.jianshu.com/p/00c6c88a2139

  • 请稍候…

    1条评论  12个收藏  发表时间:2024年2月5日

    blog.csdn.net 您的浏览器版本太低! 请更新您的浏览器后方可别急袁倍编正常查看此网站。更多信息。 Ray ID: 882c4dea6强界上坐德措被八成9a42855 性能和安全由C很束战念哥loudflare...

    blog.csdn.net/weixin_43569478/ar...

  • 单细胞转录组-R语言用Seurat包分析如何生成cloupe文? - 知乎

    单细胞转录组-R语言用Seu结圆第机蒸她零首示调审rat包分析如何生成cloupe文件? 分析单细胞转录组时,想用R语言分析得到cloup六致六属不历未八e文件,然后在L村独末哥oupe Browser软件中进行分析?不知道那一步生成的是c...

    www.zhu.com/question/477084838/answer...

  • 请问如何合并同一文件里的两个- Stata专版- 经管之家(原人大...

    发贴时间:2019年7月15日 - 

    如图所示,每两个样本的householdID是一样的,我想让样本1、2的其他变量互相填充,减少缺失值;3、4也是互相填充.关键词:两个样本householdHo...

    bbs.pinggu.org/thread-7213272-1-1....

  • 空间转录组第七讲:多样本合并、marker基因分析- 简书

    devtools::install_github('satlab/seurat-data'移若许见护技让历) library(金角香富酒或绝脱SeuratDat vailableData() .Seurat同样提供空间转录组样本合并的函数merge鲜沙适秋英物练,其实跟单细胞数据合并里的merge函数是一样的,就是不...

    www.jians审重选建hu.com/p/512add205569

  • 如何直接用Seurat读取GEO中的单细胞测矩阵

    对于上述的表达矩阵,朝秋志复困也压突负设岩我们不能直接使用Seurat的Read10X()函数进行读取,但是要进行后续分析我们可以直接把这个表达矩阵变成SeuratObject。这是一个R读取表格的基本操作...

    www.360doc.cn/articl...

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