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非冗余基因集构建 - 百度文库

2页 发布时间: 2023年08月25日
非冗余基因集是指在一个给定的基因组中,去除重复或高度相似的基因,得到的不重复的基因集合。冗余基因是指在基因组中存在多个拷贝或变异,但功能相似或相同的基因。非冗余基因...

数字生命新时代:人工智能+多组学驱动的精准医疗 - 知乎
2023年2月17日 通过人工智能算法整合多组学数据和非组学数据,全面解析机体状态(图3)。随着多组学技术的蓬勃发展,基于人工智能的多组学分析将极大地促进临床诊疗决策的发展,尤其是在精准医疗领域。...
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非冗余基因是什么意思 - 百度知道

1个回答 - 回答时间: 2023年11月28日

最佳答案: 根据查询百度文库显示，非冗余基因集是指在一个给定的基因组中，去除重复或高度相似的基因，得到的不重复的基因集合。冗余基因是指在基因组中存在多个拷贝或变异，...
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宏基因组 - (4)使用dbCAN2对非冗余基因集进行CaZy注释(待...
2021年12月17日 如图 我这里用的非冗余基因集当然只能算相对丰度了~ 关于如何做还有待更新。。。 2022.3更新 像上文那样处理是存在问题的,所以写了两个脚本 最开始是处理eggnogmapper的输出结果,...
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...非冗余微生物基因集GMGCv1的构建_非冗余基因集-CSDN博客
2021年12月21日 本文选取了全球范围内14种主要生境的一万余组已公开的宏基因组测序数据进行非冗余基因集的构建,共获得3.03亿个物种水平的基因。这些基因被进一步聚类为3200万余个蛋白质家族,且少...
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一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法
2023年2月4日 12.方法1:构建步骤(1)中过滤后的数据的拼接集,得到二代拼接集,利用贝叶斯模型方法将步骤(2)中过滤后的数据来填补二代拼接集中间不能相连的片段,得到contigs;13.方法2:使用hybridspad...

宏基因组学分析简介 - 腾讯云开发者社区-腾讯云

2018年2月27日 下图是宏基因组分析的一般流程: 相关名词解释 基因集(Gene Catalog):由所有样本中检测到的基因构成的集合。非冗余基因集(Non-redundant Gene Catalog):将所有...
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宏基因组_微科盟_结题报告
3) 物种注释:用diamond 将非冗余蛋白比对到NCBI NR蛋白数据库,比对结果再用BASTA软件分析得到非冗余蛋白的物种注释信息;同时使用Kraken2和自建的微生物核酸数据库(筛选NCBI NT核酸数据库和RefSeq...

Genome Biology:癌症突变组学特征数据冗余普遍存在!简单的...
2022年7月30日 图2.三个基因集的总体性能分布。来源:Genome Biology 比较不同数据集的预测性能 接下来,研究团队比较了TCGA泛癌图谱中五种可用的功能数据类型(因为有两个DNA甲基化平台,所以共六个r...
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Nature:宏基因组关联分析综述——你想要的全在这
2017年12月27日 通过对组装后的contigs进行基因预测,并去除样品间高度相似的基因序列,得到非冗余基因集。基因的丰度、分类和功能都是基于这个参考基因集而被量化,从而进行微生物与疾病之间的关系...
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