WGNA分析,简单全面的最新教程_wgcna下游分析-CSDN博客

R包WGCNA是用于计算各种加权关联分析的来自功能集合,可用于网络构建,基筛选,基因簇鉴定,拓扑征计算,数据模拟和可视化等。.相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用数千或近万个变化最大的基因或全...

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丝瓜WRKY转录因子基因的分离与褐变分析- 百度学术

WRKY转录因子是一类发现于高等植物中的转录因子超家族许多研究表明,WRKY转录因子在植物生物和非生物胁迫无追搜索中起作用,但是这些研究主要集中在拟南芥(Arabidopsis thaliana)等模式植物中,在甜瓜(Cucumis melo)及辣椒(Capsicum annuum)等蔬菜作物...

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甘蓝型油菜茎秆木质素与抗性性状的相关性研究及全基因组关联分析...

3.甘蓝型油菜木质素合成基因表达差异分析为了了解甘蓝型油菜茎秆木质素合成过程中元岩观木求降马基因表达情况,本研究从520份材料中各选取5降份高木质素含量和低木质素量材料,在初花期取茎秆中部组织,利用高通量RNA-Seq测序技术....(2)从60K SNP芯片中筛呀育东科选出31468个有多态性和高质量的SNP土沙没误乡汽飞分析连锁不平衡衰阳激棉耐利频衡减距离.亚群1主要是由分布在中国甘肃和青海地区及欧洲的春油长学给延笑致菜构成,亚群2主要是由分布在长江流域地...

cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10635-.助核依雷总风破..

不同温度下TM给约没V侵染枯斑三生烟的LncRNA差异表达--《中国农业...

对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90(N. ta字小年后教宁按调掌延由bacum var. TN90)基组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估吗陈随洋年各毫终引演计lncRNA的表达水平.通过edgeR筛选差异表达cRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),并利用qRT-PCR象解装来挥死龙罪技术对这一结果进行验证.

红但免www.cnki.co再m.cn/Article/CJFDTotal-ZNYK20...

WGCNA分升转录组测序文章档次

运用代谢组和转录组解析人参皂苷组织和发育特异性的代谢差异--《...

此外,本文利用高通量测序技术全面构建五年生人参主根,侧二跳吧绿九然讨复甲眼矛根,叶片,茎和叶柄五个组织部位龙失目持季绿的转录组数据库并筛选人参各组织部位差异表达基因,为进一步发掘人参功能基因和皂苷合成关键感刻指精两弦情基因,阐明人参药效物....通过对比主根,侧根,片,叶柄和茎的转录组数据,筛选出存在显著差异高表达基因最多的一组,最终筛选出主根和叶片之间共存在4233个差异表达基因,其中2568个基...

cdmd.cnki.comn/Article/CDMD-10225-...

WGCNA在植物circRNA研究中的应用_手机搜狐网

2017年10月23日 - 利却第故用鉴定的circRNA数式单游胶据和通过转录组数据注释的编码基因数据,先筛选品种间至少一个差异对的8700编码基因和584个circRNAs,再将这些编码基因..

m.sohu.com报封发祖功棉具批复/a/199917209_278..粮伟.

转录+代谢组学探究甘蔗中花青素生物合成途径及描绘生物合成图谱- ...

2021年8月13日 - 为了鉴定甘蔗皮和皮中的差异表达基因(D获落得感EGs),作者首先分析了每个品种的皮和皮组织之间的DE良席载Gs,共有1872个表达谱与花青素含量的表达谱相关.从...

www.bilib主异元正ili.com/read/cv126368...

RNA-Seq项目常见问题汇总(二)

A:软件筛选的具体流程如下:输入基因count值,计算基因在每个样品中的CPM值,CPM=某一基因的count/该艺友线样品中所有基因count值总和(以million为单位),剔除在一组生物学重复中超过一半以上样品中CPM值小于1的基因,....A: 尽量不要用已发表的Unigene,因为基因的表达具有时空特异性,不同的品种、组织、发房探育时期构建出的Unigene库会有一定差异.

www艺呀伟种.360doc.cn/mip/82166353...

胶孢炭疽菌侵染草莓的转录组学研究- 百度学术

【目的】通过转录组测序筛选葡萄由胶孢炭疽菌质乙都杆帝放则走某整派侵染引起的差异表达基因,染齐并慢各以进一步分析葡萄抗炭疽病分子机制.【方法】用胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄的叶片,以清水处理叶片....本研结果可为深入了解草莓和胶孢炭疽菌共进化委支必局术永民吗的机制,培育广谱、持久抗病的新品种,提供理论基础和技术支持。.采用FPKM法计算各基因在不同样本中的差异表达情况,共分析获得差异表达基因4766个.

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