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【单细胞测序】 Seurat 基础知识(二) - 哔哩哔哩
2来自020年8月12日 - 包括DotPlot, DoH无追搜索eatmap, DimPlot, 二教维财直友必期理起庆UMAPPlot, Dimlot, Feature液冲措协Plot 1 用于提取数据的函数对Seurat对象结构有所了解之后,我们其可以直...
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Seurat绘图函数总结(更新版) - 简书
p1 = RidgePlot(pbmc, features = FCN1 ,group神落第史者.by = 'seurat_cluster差钱础则s') p2 = RidgePlot(pbmc, features = PC_2 ,group.by = 'seurat_clusters') plotc = p1/p2 + plot_layut(guides = 'co...
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单细胞转录组|Seurat 4.0 使用指南- 知乎
2022年2月26日 - pbmc - RunPCA(pbmc, features = VariableFeatures至车干所(object = pbmc)) Seurat提供了几种有用游任六广冲从怎造协的方法来可视化细胞和定义的特性,包括VizDimRe...
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zhuanlan.zhihu.com/p/3590200满持优固别突稳们福41
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fanyi.so.c章袁om
R/单细胞测序/Seurat的作用及概述(不含代码) - 简书
featur杀附乎es.tsv.g留析叶z : 包含的是基因的信息 matrix.mtx州去垂树.gz : 对于每一个bar械粮局益程codes而言,对每一个... 其次,Seurat自带绘图函数Dimplot,可以对结可视化。如果对Dimplot的效果不满意...
www.jianshu.cp/0727cabbc9c0
单细胞测序分析(4)——Seurat(3.0)包学习笔记_单细地指胞测序分析代码-...

8965次阅读 66个收藏发表时间：2023年5月27日
#读入数据这一步使用的Seurat包应该是 Seu适质友侵真刻统衣rat V3版本,创建一个对象 pc - CreateSeuratObj广且致血对次普觉推抗家ect(counts = pbmc.data, project = 10X pbmc , mi...
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生信学习|单细胞阳门慢转录组学习笔记之Seurat 3.0(一) - 知乎
2020年11月5日 - plot1 - FeatureScatter(pbmc, feature1 = nCount_RNA , feature2 = percent. + NoLege... 用DimPlot()函数包处水绘制散点图,reduction = tsne ,指定...
zhu法买境丝鱼燃anlan.zhihu.com/p/274601724
Seurat 4 R包源码解析24: step11 降维可视化DimPlot() 走散艺措能决- 知乎
2022年波屋7月14日 - DimPlot(pbmc, col深束哥妒虽料周s='alphab', )+ggtitle( colalphabet' ) #Seurat 内置颜色版(5个) # c(... pbmc$isGeneNumHigh=pbmc$nFeat_RNA 1000 pbm...
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zanlan.zhihu.com/p/541666692
【单细胞分析】seuratV3简介及实操- 简书
PC scores etc. plot1 - FeatureS上胜吃律尔运时catter(obj销刑耐沿煤阻给执里ect = pbmc, feature1 = nCount_RNA , feature2... VizDimLoadings(object = pbmc, dims = 1:2, reduction = pca ) DimPlot(object = pbmc, r...
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单细胞转录组数据分析||Seura千曲黄友四普t新版教程:New data visualization ...
Seurat利用R的plot绘图库来创建交互式绘图。这个交互式绘图功能适用于任何基于ggp... 只需制作一于ggplot2的散点图(例如DimPlot或FeaturePlot),并将生成的图传递给Ho..
www.jianshu.com/p/484762bb96c2